Küsimus:
Alternatiivsed geneetilised koodid äsja järjestatud organismides
Daniel Standage
2011-12-22 11:35:08 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Standardse geneetilise koodi variatsioonid on üsna haruldased, kuid kuna suure läbilaskevõimega genoomi järjestamise kulud vähenevad jätkuvalt, on suurem võimalus leida täiendavaid erandeid. Nagu öeldud, on genoomiprojektides selgelt rõhutatud nukleotiidide (genoomi ja transkriptoomide) sekveneerimist, kusjuures proteoomikatööle tehakse palju vähem (kui üldse) jõupingutusi (parandage mind, kui ma eksin).

Teie küsimus on väga ebamäärane. Kas oskate olla konkreetsem ja / või konkreetsem? Geneetilises koodis on tosin sekveneerimistehnoloogiat ja veelgi rohkem variatsioone.
Võib-olla tuleneb ebamäärasus sellest, et ma ei tea, mida oodata, kui üritaksin märkida alternatiivset geneetilist koodi kasutava organismi genoomi. Minu põhiküsimus on: kas ma üldse suudaksin öelda? Kas see ei selgu algsest küsimusest?
Ma arvan, et see on selge küsimus.
Kolm vastused:
#1
+6
chkuo
2012-01-06 00:34:08 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Kui organism kasutab alternatiivset koodi, sisaldaksid prognoositavad valgujärjestused alati sama tüüpi aminohapete asendusvigu. See muster peaks ilmnema, kui võrrelda valke teiste organismidega. Tegelikult kasutab kõige tavalisem alternatiivne kood trüptofaani jaoks tavalise peatuse asemel UGA-d. Kui teete vea, kasutades nende genoomide jaoks standardset koodi, muutuvad prognoositavad geenid väga killustatuks, nii et seda on peaaegu võimatu mitte märgata.

#2
+3
KAM
2011-12-22 19:45:44 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Teil on õigus olla veidi mures, eriti mitokondrite genoomide pärast (kus mittestandardsed geneetilised koodid on levinumad). Lisaks mittestandardsete koodide kasutamisele peaksite kaaluma ka RNA redigeerimist (muudetud koodonid või kustutatud / sisestatud nukleotiidid lugemisraamide nihutamiseks) ja spetsiaalseid aminohappeid (nt selenotsüsteiin). Kokkuvõttes on DNA järjestuse rõhutamine valgu struktuuri järeldamiseks ohutu enamikul juhtudel, kuid ärge üllatage erinevustest (konkreetsete geenide või tervete organismide puhul).

#3
+2
Thomas Ingalls
2011-12-22 13:09:47 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Lühike vastus on jah, võite lõpuks saada palju vigu. Lisateavet leiate siit:

NCBI: "Geneetilised koodid"



See küsimus ja vastus tõlgiti automaatselt inglise keelest.Algne sisu on saadaval stackexchange-is, mida täname cc by-sa 3.0-litsentsi eest, mille all seda levitatakse.
Loading...