Küsimus:
Kas siRNA võib indutseerida imetajate rakkudes DNA metüülimist?
Mad Scientist
2011-12-16 15:00:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Mõni aasta tagasi avaldasid Hiroaki Kawasaki ja Kazunari Taira Nature'is artikli "DNA metüülimise ja geenivaigistamise indutseerimine lühikeste häirivate RNA-dega inimrakkudes":

Taimedes võivad promootori CpG saartele suunatud dsRNA-d indutseerida ka RNA-suunatud DNA metüülimist ; siiski jääb selgusetuks, kas dsRNA-d võivad imetajarakkudes esile kutsuda DNA metüleerimise vahendatud geeni vaigistamise. Siin demonstreerime, et lühikesed segavad RNA-d (siRNA-d; 21–25-nukleotiidsed RNA molekulid) indutseerivad inimese rakkudes DNA metüülimist ja histooni H3 metüülimist.

See artikkel näis näitavat, et siRNA võib ka kutsuda esile geenide pikaajalist vaigistamist imetajarakkudes DNA metüleerimise teel, mida pole varem täheldatud Kahjuks tõmmati paber hiljem tagasi, seades tulemused kahtluse alla.

Mulle tundus see artikkel väga põnev, kuna see pakkus välja võimaluse geeniteraapia tegemiseks, vaikimiseks. spetsiifilised geenid, kasutades ainult RNA-interferentsi

Milline on siinne teaduslik üksmeel, kas on veenvaid tõendeid selle kohta, et siRNA-indutseeritud DNA metüülimine on imetajarakkudes võimalik? Kas keegi suutis Kawasaki ja Taira tulemusi korrata?

üks vastus:
#1
+15
Rik Smith-Unna
2012-02-01 06:05:33 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Kirjanduse lühiülevaate põhjal tundub, et kogukond on Kawasaki ja Tairat suures osas enne ja pärast oma kirjutist kinnitanud. Tagasivõtmine toimus ainult Taira poolt, Kawasaki keeldus kaasallkirjastamast, kuna ta väitis, et andmed kehtivad. Tagasitõmbamise põhjal näib tagasitõmbamise põhjus olevat kadunud laboriraamat.

Enne Kawasaki ja Taiga artiklit oli juba mitu teist artiklit, mis kirjeldasid imetajate RNAi-indutseeritud epigeneetilist modifikatsiooni:

Siis oli järgmisel aastal veel üks Kawasaki & Taira paber, mida tagasi ei võetud:

Ja tundub, et ideed on nüüdseks üldtunnustatud ja toetatud üsna paljudes teistes uuringutes, peamiselt idurakkude uurimises . Näiteks:

Pole ühtegi ülevaadet, mida võiksin leida ja mis seob seda kõike veenvalt, kuid RNAi kohta on mitmeid ülevaateid suunatud histooni ja kromatiini modifitseerimine üldiselt, milles mainitakse, et tõsiasi on nüüdseks imetajatel tõestatud:

Sugurakkude viide (Carmell et al., 2007) ei kirjelda siRNA-d, selle asemel käsitleb see täiesti erinevat väikeste RNA-de klassi, mida nimetatakse piRNA-ks (dokumendis nimetasid nad neid rasiRNA-ks, kuid piRNA on nüüd üldkasutatav nomenklatuur) . SiRNA ja piRNA (suuruse jaotused ja valgud, millega nad seostuvad) vahel on olulised erinevused ja neid ei tohiks segamini ajada.
Sirvisin teie viidatud Joshua-Tori ja Hannoni (2010) ülevaadet ning pole märganud ühtegi siRNA-d, mis suunaksid imetajate DNA metüleerimist (või histooni modifikatsiooni). Vabandust, kui ma selle vahele jäin, kas saaksite tsiteerida vastavat lauset?
@Sergei teil on õigus! Selles artiklis mainitakse tegelikult piRNA-d suunatud metüülimist, mitte siRNA-d. Jätan selle vastusesse, kuna see on küsimuse jaoks endiselt asjakohane.


See küsimus ja vastus tõlgiti automaatselt inglise keelest.Algne sisu on saadaval stackexchange-is, mida täname cc by-sa 3.0-litsentsi eest, mille all seda levitatakse.
Loading...