Küsimus:
Kuidas jäävad CpG saared metüleerimata?
nico
2011-12-30 16:26:00 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Enamikus genoomidest on CpG saitid peaaegu alati metüleeritud, kuid CpG saared on selle asemel sageli metüleerimata. Seda on seostatud asjaoluga, et neid seostatakse sageli transkribeeritud geenidega.

Millised on praegused teooriad selle demetüülimisega seotud soodusmehhanismide kohta?

üks vastus:
#1
+11
KAM
2011-12-30 17:47:05 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Metüülimist peetakse üha enam geeniaktiivsuse kui regulatiivse mehhanismi tagajärjeks. On juhtumeid, kus metüülimist kontrollitakse geeniregulatsiooni kontrolli tõttu , eriti kuulsas H19 / Igf2 lookuses [ 1] . Siin on hiljuti üldiselt hea ülevaade [ 2] . Pange tähele, et seal mainitakse, et DNA metüülimine ei põhjusta transkriptsiooni vaigistamist ja tõenäoliselt metüleeritud promootorid on tõenäoliselt > aktiivsed kui metüleerimata, loovad nad metüleerimisel lihtsalt vaigistavad RNA-d (mille tulemuseks on näiline vaigistamine). See võib aidata selgitada mõnda lugu [ 3] , kuid pange tähele, kui vana see paber on, kuid üldiselt ütleksin, et vähesed teavad selle olemasolust.

Erand näib olevat ülekantavad elemendid [ 4] , kuid nende juhtimist kontrollib tõenäoliselt ka RNA-de vaigistamine.

Viited:

  1. Zampieri M, Guastafierro T, Calabrese R, Ciccarone F, Bacalini MG, Reale A, Perilli M, Passananti C, Caiafa P . 2012. ADP-riboosi polümeerid, mis on lokaliseeritud Ctcf-Parp1-Dnmt1 kompleksil, takistavad Ctcf-i märksaitide metüülimist. Biokeemiline ajakiri 441: 645–52.

  2. Deaton AM, Bird A . 2011. CpG saared ja transkriptsiooni reguleerimine. Geenid &i väljatöötamine 25: 1010–22.

  3. Rountree MR, Selker EU . 1997. DNA metüülimine pärsib Neurospora crassa pikenemist, kuid mitte transkriptsiooni algatamist. Geenid & Development 11: 2383–2395.

  4. Bourc’his D, Bestor TH . 2004. Meiootiline katastroof ja retrotransposooni taasaktiveerimine isastel idurakkudel, millel puudus Dnmt3L. Loodus 431: 96–9.

See tuli välja vaid mõni tund tagasi (http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1002422). Ema SNRPN alleeli (mis on metüleerimata) jäljendamine nõuab transkriptsiooni, rõhutades jällegi, et metüülimine on pigem transkriptsioonivaigistuse tagajärg, mitte geenivaigistamisel põhjuslik.


See küsimus ja vastus tõlgiti automaatselt inglise keelest.Algne sisu on saadaval stackexchange-is, mida täname cc by-sa 3.0-litsentsi eest, mille all seda levitatakse.
Loading...