Küsimus:
Geeniekspressiooni aegridade võrdlus in vitro ja in vivo
Marco
2015-05-28 17:31:53 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Pean analüüsima kahte andmekogumit, mis koosnevad geeniekspressiooni aegridade mõõtmistest. Üks komplekt on in vivo andmed ekspressiooniprofiilidest, mis on saadud paar päeva enne sündi kuni mitu päeva pärast sünnitust. Teine andmekogum saadi C2C12 rakuliinis, kus t = 0 määratleti päevana, mil jõuti 100% ühinemiseni. ? Lihtsalt joondage kaks rida, kasutades kahte t = 0 proovi, kuna lähtepunkt tundub meelevaldne.

Tere tulemast bioloogiasse! Püüdsin küsimust selgitada. Keerake julgelt tagasi, kui see ei kajasta enam teie küsimust.
Ma hakkaksin endalt küsima: kas on mõtet neid kahte sarja joondada? Teisisõnu, kas teil on tõendeid selle kohta, et in vitro katse sündmused võivad vastata sündmustele in vivo? Abi oleks sellest, kui kirjeldaksite oma katset veidi üksikasjalikumalt (võimaluse korral võib see olla tundlik teave). Milline liik, mis kude, millised katsetingimused, mis on teie teaduslik küsimus.
Tere, jah, see on tundlik teave ... aga aitäh vastuse eest, püüan välja selgitada, kas on olemas parim nihe, mis maksimeerib paaride vahelist seost. Kui mitte kõike ei saa otsida üles / alla reguleerimisest ...
See on mesenhümaalne rakuliin, mis erineb in vitro pärast liitumispunkti (ja seerumi puudust) jõudmist. Loomadel on tõenäoliselt sarnaseid rakke, kuid see võib olla väike protsent rakkude koguarvust. In vitro diferentseerumise ajal võite eeldada, et mõned geenid lähevad aja jooksul alla ja teised tõusevad. Loomadel soodustavad signaali tõenäoliselt koespetsiifilised geenid kümnetest kudedest ja sadadest rakutüüpidest.
üks vastus:
243
2015-05-28 22:32:52 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Kude ja kultiveeritud rakkude vahel oleks keeruline otseselt ravikuuri võrrelda. Ajaskaala asemel võiksite kasutada markereid. Näiteks Kislinger jt. näitavad, et SIX1 ekspressiooni tipp on 2 päeva pärast diferentseerumist; SMAD3, 4 päeva. Ma ei ole õige inimene, kes oskaks öelda, millised markerid on head, kuid usun, et leiate lisateavet kirjanduse otsingu kaudu.

http://www.mcponline.org/content/4/ 7/887. Täielik



See küsimus ja vastus tõlgiti automaatselt inglise keelest.Algne sisu on saadaval stackexchange-is, mida täname cc by-sa 3.0-litsentsi eest, mille all seda levitatakse.
Loading...